非氧化型殺菌劑包括異噻唑啉酮及其衍生物、有機溴類化合物、胺類化合物和酚類化合物等，其選擇性好。目前市場上銷售的高效廣普殺菌劑通常是非氧化型的殺菌劑，其殺菌機理是增加細胞膜的滲透，切斷細胞管營養(yǎng)物質(zhì)的供應(yīng)，破壞細胞內(nèi)部的新陳代謝，或者改變細胞蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)，阻止細胞內(nèi)部能量產(chǎn)生和限制酶的合成。所以此類殺菌劑對浮游微生物和生物膜作用非常好，它不僅能限制和消除現(xiàn)存的生物膜，而且還能滲透到生物膜的內(nèi)部與留在生物膜內(nèi)部的厭氧型微生物起反應(yīng)。對某種非氧化型殺菌劑來說，它僅局限于對某些微生物起作用，這與氧化型殺菌劑是不相同的。

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